Ito ang Linux app na pinangalanang ForceGen na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang ForceGenV0.4.jar. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang ForceGen na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
ForceGen
DESCRIPTION
Mangyaring banggitin:ForceGen: atomic covalent bond constant derivation para sa Gromacs. Nash A, Collier T, Birch HL, de Leeuw NH. Journal of Molecular Modeling (2018), (24)5. DOI: 10.1007/s00894-017-3530-6
Video ng pagtuturo:
https://youtu.be/fQVXv8Ge_tg
Nakukuha ng Java executable jar na ito ang second order na bond force constants para sa bond stretch at bond angle mula sa quantum mechanical Gaussian calculations. Ang mga kalkulasyon ay tugma sa Amber force field family o anumang force field na nagmula sa second order tensor ng Hessian mula sa mga molekular na fragment. Ang output ay ginawang tugma sa format ng topology ng Gromacs.
Kasama sa mga halimbawa ng paggamit ang derivation ng bond force constants at equilibrium values para sa:
-nakagapos na mga metal sa mga aktibong site ng protina
- binagong mga amino acid
-maliit na molekula/molekula ng gamot
Ang isang zip ng mga halimbawang file ay matatagpuan sa pamamagitan ng pagsunod sa link na "Browse All Files."
Isinulat ni Dr Anthony Nash (Oxford)
Sinusuportahan ni Dr Thomas Collier, Prof Helen Birch &
Mga tampok
- Bond stretch force pare-pareho ang derivation
- Ang anggulo ng bono ay palaging nagmula sa puwersa
- Pagkatugma sa topology ng Gromacs
Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/forcegen/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
