Ito ang Linux app na pinangalanang Grinder na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang Grinder-0.5.4.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Grinder para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
Grinder na tatakbo sa Linux online
Ad
DESCRIPTION
Ang Grinder ay isang versatile na open-source na bioinformatic na tool upang lumikha ng simulate omic shotgun at amplicon sequence library para sa lahat ng pangunahing sequencing platform.Mga tampok
- shotgun o amplicon (eg 16S rRNA) basahin ang mga aklatan
- suporta ng omics upang makabuo ng genomic, transcriptomic, proteomic, metagenomic, metatranscriptomic o metaproteomic na mga dataset
- di-makatwirang pamamahagi ng haba ng pagbasa at bilang ng mga nabasa
- simulation ng PCR at sequencing errors (chimeras, point mutations, homopolymers)
- suporta para sa mga dataset ng paired-end (mate pair).
- mga partikular na setting ng rank-abundance o manu-manong ibinigay na kasaganaan para sa bawat genome, gene o protina
- paglikha ng mga dataset na may ibinigay na kayamanan (alpha diversity)
- ang mga nauugnay na dataset ay maaaring magbahagi ng variable na bilang ng mga genome (beta diversity)
- pagmomodelo ng bias na nilikha ng iba't ibang haba ng genome o numero ng kopya ng gene
- mekanismo ng profile upang mag-imbak ng mga ginustong opsyon
- magagamit sa mga biologist o power user sa pamamagitan ng maraming interface: GUI, CLI at API
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Console/Terminal
Wika ng Programming
Perl
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/biogrinder/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
