Ito ang Linux app na pinangalanang JSiteDescriptor na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang binaries.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang JSiteDescriptor na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
JSiteDescriptor
Ad
DESCRIPTION
Isang set ng mga java program na kumukuha ng coordinate at chemical na impormasyon mula sa mga PDB file.
Ang mga rehiyon ng nagbubuklod na site ay kinukuha gamit ang grid based scheme.
Para sa binding site, ang spatio-chemical descriptor ay nabuo batay sa PocketMatch algorithm ni Dr. Kalidas (may-akda din ng proyektong ito).
Mga tampok
- Pagbuo ng PocketMatch based na vector descriptor para sa isang binding site
- Tumatakbo sa solong PDB file mode o Batch mode
- Pagtutukoy ng site bilang ligand neighborhood - (Ligand code, pangalan at chain ID)
- Pagtutukoy ng site bilang PDB subset neighborhood gamit ang REGULAR EXPRESSIONS
- Pagtutukoy ng maramihang mga hanay ng mga atom na naglinya sa isang binding site
- Kinukuha ng batch mode processing file ang mga parameter ng input sa pamamagitan ng XML file + na naaayon sa detalye ng XSD
- Mas mahusay na pagsasaayos - pagpili ng natitirang pangkat, radius at mga kategorya para sa mga site
- teknolohiya ng Java Swing para sa GUI
- Simple at extensible na arkitektura ng software para sa pag-unlad sa hinaharap
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Java Swing
Wika ng Programming
Java
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/jsitedescriptor/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
