Ito ang Linux app na pinangalanang MetaPhat -meta-pheno-association-tracker na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang meta_phat.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang MetaPhat -meta-pheno-association-tracker sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
MetaPhat -meta-pheno-association-tracker
DESCRIPTION
Ang MetaPhat ay isang aktibo at open sourced (MIT license) na tool upang makita ang mga variant na may mga multivariate na asosasyon sa pamamagitan ng paggamit ng buod na istatistika mula sa univariate na pag-aaral ng GWAS. Nagsasagawa rin ang application ng decomposition sa pamamagitan ng paghahanap ng pinakamainam na BIC subset at P-value na mga katangian ng driver para sa mga multivariate na lead variant. Sinusubaybayan at pinagsama-sama ang mga resulta ng variant upang tumulong sa pag-dissect ng mga ugnayang phenotype-genotype.Mangyaring tingnan ang aming wiki home para sa mga tagubilin sa pag-install, kinakailangang mga format ng data ng GWAS at mga halimbawang input na may test command - https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
Global lipids (GLGC, Willer 2013) data/source tar halimbawa - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Kung magkakaroon ka ng mga problema o may mga kahilingan sa tampok pagkatapos subukan ang halimbawa at pagbabasa ng tutorial, mangyaring mag-email: [protektado ng email]
Copyright <2019> [protektado ng email], [protektado ng email]
Mga tampok
- multivariate genome-wide trait analysis
- p-value at BIC na nakabatay sa pinakamainam na pagpili ng subset ng katangian
- trait decomposition trace plots
- lead SNP at driver trait summary file
- snp-snp trait rank spearman cluster
Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.