Ito ang Linux app na pinangalanang MoPAC na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang MoPAC_0.3.1.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang MoPAC na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
MoPAC
DESCRIPTION
Upang mapadali ang paghahambing ng mga mahahalagang gene sa dalawa o higit pang mga sample ng cell, iminungkahi namin ang MoPAC (Modular Pipeline para sa Pagsusuri ng mga screen ng CRISPR), isang Shiny-driven na interactive na tool para sa differential essentiality analysis sa mga screen ng CRISPR/Cas9.
Para sa mga tagubilin sa pag-install at paggamit mangyaring sumangguni sa pahina ng wiki.
Mga tampok
- Walang pinapanigan na pagsukat ng differential gene essentiality sa mga screen ng CRISPR.
- Dali ng paggamit sa pamamagitan ng interactive na graphical user interphase.
- Mga figure na handa sa publikasyon na nabuo sa bawat hakbang ng pagsusuri.
- Parehong FASTQ file at read-count na mga talahanayan (bago o pagkatapos ng normalisasyon) pinapayagan bilang input.
- Gene-category-based na kontrol sa kalidad para sa outlier detection at pag-filter.
- Gene ontology analysis built-in sa pamamagitan ng STRINGdb R package.
- Mabilis na pagpoproseso sa pamamagitan ng C++ compilation ng mga kalkulasyon-intensive na hakbang.
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Web-based
Wika ng Programming
C++, S/R
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/mopac/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
