Ito ang Linux app na pinangalanang PPSeq: Parallel NGS Analysis na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang PPSeq: Parallel NGS Analysis para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
PPSeq: Parallel NGS Analysis na tatakbo sa Linux online
DESCRIPTION
Ang high-throughput next generation sequencing (NGS) na teknolohiya ay mabilis na lumitaw bilang isang makapangyarihang tool sa maraming aspeto ng biomedical na pananaliksik. Gayunpaman, kasama ng mabilis na pag-unlad nito, ang magnitude ng data at pagiging kumplikado ng pagsusuri para sa NGS ay higit na lumampas sa kapasidad at kakayahan ng mga tradisyunal na maliliit na pasilidad sa pag-compute, tulad ng mga multithreading algorithm sa mga standalone na workstation. Upang matugunan ang isyung ito, narito ang isang solusyon gamit ang patuloy na pagtaas ng supply ng kapangyarihan sa pagpoproseso ng napakalaking parallel processing (MPP) system.Mga tampok
- ppalgn - pag-align ng sequencing reads sa mahabang reference sequence
- ppbwt - pagbuo ng FM-index mula sa isang set ng mga sequence ng DNA
Audience
Edukasyon, Inhinyero, Industriya ng Pangangalaga sa Kalusugan, Teknolohiya ng Impormasyon, Mga Non-Profit na Organisasyon, Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
C + +
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/ppseq/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
