Ito ang Linux app na pinangalanang Protospacer Workbench na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang Protospacer_Workbench.MacOSX.64bit.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Protospacer Workbench na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
Protospacer Workbench
DESCRIPTION
Tumutulong ang Protospacer Workbench na magdisenyo, magsuri, at magbahagi ng mga target-site ng CRISPR para sa anumang organismo o hanay ng mga naka-format na sequence ng FASTA.Ang disenyo ng mga guide-RNA para sa CRISPR/Cas genome editing system ay intuitively madali, ngunit computationally mahirap. Ang pangunahing kahirapan ay nagmumula sa pangangailangang tukuyin ang mga potensyal na off-target na maaaring medyo iba sa nilalayong target. Ang mga kasalukuyang online na tool para sa disenyo ng guide-RNA ay nagbibigay ng user friendly na interface sa sequence mapping software gaya ng Bowtie o BLAST. Gayunpaman, habang mabilis, ang mga algorithm sa pagmamapa na ito ay hindi idinisenyo na may mataas na tolerance sa error, isang tampok na kritikal sa pagtukoy ng mga potensyal na hindi target. Kung saan nabigo ang mga online na tool, nagtatagumpay ang mga offline na tool. Gayunpaman, ang mga offline na tool ay nangangailangan ng kaalaman sa command line na kakaunti, na gumagamit ng CRISPR, ay mayroon. Layunin ng Protospacer Workbench na tulay ang agwat sa pagitan ng online at offline na disenyo ng gabay-RNA. Kasalukuyang available ang software para sa OS X at ipo-port sa ibang mga operating system sa lalong madaling panahon.
Mga tampok
- Mabilis na mahanap ang lahat ng available na CRISPR target
- Suriing mabuti ang mga disenyo ng gabay-RNA
- Magbahagi ng mga target at listahan ng gabay-RNA
- Disenyo para sa anumang organismo
- Pamahalaan ang maramihang mga database
- Hakbang-hakbang na daloy ng trabaho
- Kumuha ng mga ulat sa inaasahang pagganap ng gabay-RNA
- Gumamit ng maramihang mga tool ng third-party mula sa isang interface
- Multi-target na disenyo
- Pamahalaan ang malalaking listahan ng target/gabay-RNA
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/protospacerwb/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
