Ito ang Linux app na pinangalanang sgRNAcas9 na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang sgRNAcas9_3.0.5.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang sgRNAcas9 gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
sgRNAcas9
DESCRIPTION
Binubuo ang package na ito ng mga programa upang magsagawa ng paghahanap para sa mga target na site ng CRISPR (protospacer) na may mga parameter na tinukoy ng gumagamit, hulaan ang genome-wide Cas9 potensyal na off-target na mga cleavage site (POT), pag-uri-uriin ang POT sa tatlong kategorya, batch na disenyo ng mga oligonucleotides para sa pagbuo ng 20 -nt (nucleotides) o truncated sgRNA expression vectors, i-extract ang ninanais na haba ng mga sequence ng nucleotide na pumapalibot sa on- o off-target na mga cleavage site para sa pagdidisenyo ng mga pares ng primer ng PCR upang ma-validate ang mga mutasyon sa pamamagitan ng T7E1 cleavage assay. Mahalaga, sa pamamagitan ng pagtukoy ng mga potensyal na off-target na site sa silico, pinapayagan ng sgRNAcas9 ang pagpili ng mas tiyak na target na mga site at tinutulungan ang pagkilala sa mga bona fide na off-target na mga site, na makabuluhang pinapadali ang disenyo ng sgRNA para sa mga aplikasyon ng pag-edit ng genome.Cites: Xie S, ShenB,Zhang C, Huang X, Zhang Y. sgRNAcas9: isang software package para sa pagdidisenyo ng CRISPR sgRNA at pagsusuri ng mga potensyal na off-target na mga cleavage site. PLoS One. 2014,9(6):e100448.
http://www.biootools.com/
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/sgrnacas9/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
