Ito ang Linux app na pinangalanang Subread na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang subread-2.0.4-Windows-x86_64.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Subread sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
Subread
Ad
DESCRIPTION
Ang Subread software package ay isang tool kit para sa pagproseso ng data ng sequencing ng susunod na gen. Kabilang dito ang Subread aligner, Subjunc exon-exon junction detector at featureCounts read summarization program.
Maaaring gamitin ang subread aligner upang i-align ang parehong gDNA-seq at RNA-seq reads. Tinukoy ang subjunc aligner na idinisenyo para sa pagtuklas ng exon-exon junction. Para sa pagmamapa ng RNA-seq reads, ang Subread ay nagsasagawa ng mga lokal na alignment at ang Subjunc ay nagsasagawa ng mga global alignment. Ang subread at Subjunc ay nai-publish sa sumusunod na papel: Yang Liao, Gordon K Smyth at Wei Shi. "The Subread aligner: mabilis, tumpak at scalable read mapping by seed-and-vote", Nucleic Acids Research, 2013, 41(10):e108
Mga tampok
- read aligner
- susunod na henerasyong pagkakasunud-sunod
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
C
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/subread/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
