Ito ang Windows app na pinangalanang codonPhyML upang tumakbo sa Windows online sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang codonPhyML_dev_1.00_201407.24.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang codonPhyML upang tumakbo sa Windows online sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Magsimula ng anumang OS OnWorks online emulator mula sa website na ito, ngunit mas mahusay na Windows online emulator.
- 5. Mula sa OnWorks Windows OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application at i-install ito.
- 7. I-download ang Wine mula sa iyong mga Linux distributions software repository. Kapag na-install na, maaari mong i-double click ang app upang patakbuhin ang mga ito gamit ang Wine. Maaari mo ring subukan ang PlayOnLinux, isang magarbong interface sa ibabaw ng Wine na tutulong sa iyong mag-install ng mga sikat na programa at laro sa Windows.
Ang alak ay isang paraan upang patakbuhin ang software ng Windows sa Linux, ngunit walang kinakailangang Windows. Ang alak ay isang open-source na layer ng compatibility ng Windows na maaaring direktang magpatakbo ng mga program sa Windows sa anumang desktop ng Linux. Sa totoo lang, sinusubukan ng Wine na muling ipatupad ang sapat na Windows mula sa simula upang mapatakbo nito ang lahat ng mga Windows application na iyon nang hindi talaga nangangailangan ng Windows.
MGA LALAKI
Ad
codonPhyML upang tumakbo sa Windows online sa Linux online
DESCRIPTION
Ang codonPhyML ay gumagamit ng Markovian codon na mga modelo ng ebolusyon sa phylogeny reconstruction. Dahil sa isang hanay ng mga species na nailalarawan ng kanilang mga sequence ng DNA bilang input, ibabalik ng codonPhyML ang phylogenetic tree na pinakamahusay na naglalarawan sa kanilang ebolusyonaryong relasyon. Ang aming papel na naglalarawan sa codonPhyML ay nai-publish sa journal na "Molecular Biology and Evolution" (MBE). Para sa karagdagang detalye, sundan ang link: http://mbe.oxfordjournals.org/content/30/6/1270. Ang codonPhyML ay nasa cover ng MBE! Tingnan ito (Agosto 2013): http://mbe.oxfordjournals.org/content/30/8.toc.Para sa multimodel na bersyon ng CodonPhyML, mangyaring gamitin ang 'codonphyml_multi.tgz' tarball.
Mga tampok
- Markovian codon models of evolution: Goldman & Yang 1994, Muse & Gaut 1994, Kosiol et al 2007, Schneider et al 2005, Yap et al 2010
- Ang NNI at SPR tree topology ay naghahanap ng heuristic
- mga parameter ng rate ng pagpapalit na tinatantya ng pinakamataas na posibilidad
- multicore na suporta sa pamamagitan ng OpenMP
- posibilidad na maihahambing sa iba't ibang modelo (ibig sabihin, AA, NT at CODON)
Audience
Agham/Pananaliksik, Edukasyon
Interface ng gumagamit
Console/Terminal, Command-line
Wika ng Programming
C
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/codonphyml/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
