Ito ang Windows app na pinangalanang Covidex na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang Covidex_2021_11_27.rar. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Covidex sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Magsimula ng anumang OS OnWorks online emulator mula sa website na ito, ngunit mas mahusay na Windows online emulator.
- 5. Mula sa OnWorks Windows OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application at i-install ito.
- 7. I-download ang Wine mula sa iyong mga Linux distributions software repository. Kapag na-install na, maaari mong i-double click ang app upang patakbuhin ang mga ito gamit ang Wine. Maaari mo ring subukan ang PlayOnLinux, isang magarbong interface sa ibabaw ng Wine na tutulong sa iyong mag-install ng mga sikat na programa at laro sa Windows.
Ang alak ay isang paraan upang patakbuhin ang software ng Windows sa Linux, ngunit walang kinakailangang Windows. Ang alak ay isang open-source na layer ng compatibility ng Windows na maaaring direktang magpatakbo ng mga program sa Windows sa anumang desktop ng Linux. Sa totoo lang, sinusubukan ng Wine na muling ipatupad ang sapat na Windows mula sa simula upang mapatakbo nito ang lahat ng mga Windows application na iyon nang hindi talaga nangangailangan ng Windows.
MGA LALAKI
Ad
Covidex
DESCRIPTION
Ang mga viral subtype o clade ay kumakatawan sa mga cluster sa mga isolates mula sa pandaigdigang populasyon ng isang tinukoy na species. May kaugnayan ang subtypification para sa mga pag-aaral sa epidemiology ng virus, ebolusyon at pathogenesis. Sa ganitong kahulugan, ang Covidex ay binuo bilang isang open source alignment-free machine learning subtyping tool. Ito ay isang makintab na app na nagbibigay-daan sa mabilis at tumpak na pag-uuri ng mga viral genome sa mga paunang natukoy na kumpol. Kung higit sa 1000 sequence ang na-load ang tool ay tatakbo sa multithread mode. May kakayahang pag-uri-uriin ang 16000 genome sequence nang wala pang isang minuto (AMD Ryzen 7 1700 8-core Processor 3 GHz)
Para sa Web-based na bersyon ng app (para lang sa maliliit na dataset: 100 seqs max) mangyaring pumunta sa
http://covidex.unlu.edu.ar
Kung gumagamit ka ng Covidex mangyaring isaalang-alang ang pagbanggit sa sumusunod na preprint:
https://biorxiv.org/cgi/content/short/2020.08.21.261347v1
Kung sa tingin mo ay kapaki-pakinabang ang aking trabaho maaari mo akong bilhan ng kape! https://www.buymeacoffee.com/mcacciabue
Mga tampok
- Subtyping ng mga sequence
- User-friendly na interface
- Mga plot ng buod
- Portable na bersyon para sa Windows (Walang kinakailangang pag-install)
- Multithread mode
Audience
Agham/Pananaliksik, Mga End User/Desktop
Wika ng Programming
R
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/covidex/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
