Ito ang Windows app na pinangalanang Javamony na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang Javamony.jar. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Javamony na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Magsimula ng anumang OS OnWorks online emulator mula sa website na ito, ngunit mas mahusay na Windows online emulator.
- 5. Mula sa OnWorks Windows OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application at i-install ito.
- 7. I-download ang Wine mula sa iyong mga Linux distributions software repository. Kapag na-install na, maaari mong i-double click ang app upang patakbuhin ang mga ito gamit ang Wine. Maaari mo ring subukan ang PlayOnLinux, isang magarbong interface sa ibabaw ng Wine na tutulong sa iyong mag-install ng mga sikat na programa at laro sa Windows.
Ang alak ay isang paraan upang patakbuhin ang software ng Windows sa Linux, ngunit walang kinakailangang Windows. Ang alak ay isang open-source na layer ng compatibility ng Windows na maaaring direktang magpatakbo ng mga program sa Windows sa anumang desktop ng Linux. Sa totoo lang, sinusubukan ng Wine na muling ipatupad ang sapat na Windows mula sa simula upang mapatakbo nito ang lahat ng mga Windows application na iyon nang hindi talaga nangangailangan ng Windows.
MGA LALAKI
Ad
Javamony
DESCRIPTION
Batay sa hindi gaanong matagumpay na Pysimony (https://sourceforge.net/projects/pysimony/), ang parehong determinadong mag-aaral ay sumubok muli sa phylogenetic na problema.
Ang Javamony ay tinatawag bilang sumusunod:
java -jar Javamony.jar [input.fasta] [random / stepwise (simulang puno)] [# ng mga bootstraps] [outgroup taxon #1] [outgroup taxon #2] ...
Hindi sinadya bilang isang mapagkumpitensyang phylogenetic inference program, ang Javamony ay isang pagkakataon para sa akin na makuha ang wikang Java habang natututong tugunan at lutasin ang mga pangunahing problema sa phylogenetics. Samakatuwid, para sa sarili kong benepisyong pang-edukasyon, orihinal ang lahat ng code. Siyempre, malamang na marami rin ang mga pagkakamali.
Ipinamahagi ko ang Javamony, tulad ng ginawa ko sa Pysimony, umaasa na ito ay may halagang pang-edukasyon sa ibang tao o hindi bababa sa malabo na nakakaaliw.
Ang mga paparating na tampok ay:
- Suporta para sa mga pagkakasunud-sunod ng Amino Acid
- Suporta para sa karagdagang mga format ng file (hal. Nexus)
- Multithreading
- Mga karagdagang paraan ng pagmamarka (hal. maximum na posibilidad)
Mga tampok
- Gumagamit ng maximum na parsimony
- Nagbabasa ng FASTA input file (DNA lang)
- Outgroup na itinatag ng user
- Random at stepwise-addition panimulang puno
- Gumagamit ng SPR (subtree pruning and regrafting) tree search
- Nagsasagawa ng bootstrap
- Naglalabas ng karaniwang Newick format na may suporta sa bootstrap at mga branchlength
- Gumuguhit ng huling puno na may suporta sa bootstrap
Audience
Agham/Pananaliksik, Edukasyon
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
Java
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/javamony/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
