Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi öykünücüsü veya MAC OS çevrimiçi öykünücüsü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komut autodocktools'tur.
Program:
ADI
adt - AutoDockTools, AutoDock için bir grafik ön uç
SİNOPSİS
runAdt [seçenekleri]
TANIM
Bu kılavuz sayfası, tarafından sağlanan çıktının neredeyse birebir çevirisidir. runAdt -h
Komut.
SEÇENEKLER
Seçeneklerin bir özeti aşağıda yer almaktadır. Tam bir açıklama için bkz.
çevrimiçi olarak sunulan öğreticiler ve belgeler.
-H, --yardım et
Seçeneklerin özetini göster.
-a or --Yeniden
lastlog dosyasını oynat
--üzerine yazmaGünlüğü
günlük dosyasının üzerine yaz
--benzersizGünlük
benzersiz bir ada sahip bir günlük dosyası oluşturun
--noLog
günlüğe kaydetmeyi kapat
--noSplash
Açılış Ekranını kapat
--ölmek GUI olay döngüsünü başlatma
--özelleştirici dosya
kullanıcı tarafından belirtilen dosyayı çalıştırın
--lib paket ismi
komut kitaplıkları ekle
-v r, --görüş koşmak
komut satırında görüntü ağlarını çalıştırın
-v o, --görüş bir Zamanlar
görüş ağlarını çalıştırın ve ADT'den çıkın
-d or --dmodu modları
bir görüntüleme modu belirtin
modlar, görüntüleme modunun herhangi bir kombinasyonu olabilir
'cpk': cpk
'çizgiler': çizgiler
'ss' : ikincil yapı şeridi
'sb' : sopalar ve toplar
'lic': meyan kökü
'ms' : moleküler yüzey
'ca' : C-alfa izi
'bt' : omurga izi
'sp' : CA-spline
'sssb' : proteinler, çubuklar ve toplar için ikincil yapı
bağ çizgili diğer artıklar bağsız diğer artıklar için
-c or --cmodu modları
bir görüntüleme modu renk şeması belirtin:
'ca' : atoma göre renk
'cr' : kalıntıya göre renklendirme (RASMOL şeması)
'cc' : zincire göre renk
'cm' : moleküle göre renk
'cdg': David Goodsell'in şemasını kullanan renk
'cs' : Shapely şemasını kullanan renk kalıntıları
'css': ikincil yapı öğesine göre renk
ÖRNEK:
proteini şerit, protein olmayanı çubuk ve top olarak göster ve atom türüne göre renklendir
adt -i --dmode sssb --cmode cr myprot.pdb
adt -i -m sssb -c cr myprot.pdb
onworks.net hizmetlerini kullanarak autodocktools'u çevrimiçi kullanın
