Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komut bamtools'udur.
Program:
ADI
bamtools - BAM (genom hizalama) dosyalarını işlemek için araç takımı
SİNOPSİS
bambular [--help] KOMUT [ARGS]
TANIM
BamTools, BAM dosyalarını kullanarak araştırma analizini ve veri yönetimini kolaylaştırır. ile başa çıkıyor
tipik olarak mevcut sıralama teknolojileri tarafından üretilen muazzam miktarda veri
metin tabanlı ayrıştırıcılar tarafından kolayca işlenemeyen sıkıştırılmış, ikili biçimlerde depolanır
biyoinformatik araştırmalarında yaygın olarak kullanılmaktadır.
SEÇENEKLER
dönüştürmek
BAM ve bir dizi başka format arasında dönüştürme yapar
count BAM dosyasındaki/dosyalarındaki hizalama sayısını yazdırır
kapsama
Giriş BAM dosyasından kapsama istatistiklerini yazdırır
filtre BAM dosyalarını kullanıcı tarafından belirlenen kriterlere göre filtreler
başlık BAM başlık bilgilerini yazdırır
index BAM dosyası için dizin oluşturur
birleştirme Birden fazla BAM dosyasını tek bir dosyada birleştirin
rastgele Mevcut BAM dosyalarından rastgele hizalamaları seçin, daha çok test amaçlıdır
aracı.
çözmek
Eşleştirilmiş uç okumaları çözer (gerektiğinde IsProperPair bayrağını işaretler)
geri dön Yinelenen işaretleri kaldırır ve orijinal temel nitelikleri geri yükler
sort BAM dosyasını bazı kriterlere göre sıralar
split BAM dosyasını kullanıcı tarafından belirtilen özellikte böler ve yeni bir BAM çıktı dosyası oluşturur.
bulunan her değer
istatistikler Girilen BAM dosyalarından bazı temel istatistikleri yazdırır
Belirli bir komut hakkında daha fazla bilgi için 'bamtools help COMMAND' bölümüne bakın.
onworks.net hizmetlerini kullanarak bamtools'u çevrimiçi kullanın
