Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi öykünücüsü veya MAC OS çevrimiçi öykünücüsü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komut checktranse'dir.
Program:
ADI
checktrans - Bir proteinin STOP kodonlarını ve ORF istatistiklerini raporlar
SİNOPSİS
çek trans -sıra devamı -orfml tamsayı [-addlast boole] -outfile dış dosya
-outseq sıralı -fırsat başarı
çek trans -Yardım
TANIM
çek trans EMBOSS'un (“Avrupa Moleküler Biyoloji Açık
Yazılım Paketi”). "Nükleik:Gen bulma,Nükleik:Çeviri" komutunun bir parçasıdır.
grup(lar).
SEÇENEKLER
Giriş Bölüm
-sıra devamı
gereklidir Bölüm
-orfml tamsayı
Varsayılan değer: 100
Ek Bölüm
-addlast boole
Protein dizisindeki bir yıldız işareti, bir STOP kodonunun konumunu belirtir. çek trans
tüm ORF'lerin bir STOP kodonunda bittiğini varsayar. Diziyi bir ile bitmeye zorlamak
yıldız işareti, eğer orada zaten yoksa, checktrans'ın sona bir işaret gibi davranmasını sağlar.
potansiyel ORF. Yıldız işareti eklenirse, raporlanan sayıya dahil edilmez.
STOP'lar. Varsayılan değer: Y
Çıktı Bölüm
-outfile dış dosya
-outseq sıralı
Çıktı ORF dizilerini tutmak için dizi dosyası
-fırsat başarı
Çıktı özellikleri için dosya
onworks.net hizmetlerini kullanarak checktranse'i çevrimiçi kullanın
