Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen Correct_abundances komutudur.
Program:
ADI
Correct_abundances - genom bolluğu benzerlik düzeltme adımını çalıştırın
SİNOPSİS
doğru_abundance İSİMLER
TANIM
Benzerlik düzeltme adımını çalıştırın.
Not: Okuma eşleyicilerini elle çalıştırmak veya benzerlik oluşturmak mümkün olsa da
matrisi manuel olarak kullanıyorsanız, sağlanan Python komut dosyalarını 'run_mappers.py' kullanmanızı şiddetle tavsiye ederiz.
ve 'create_similarity_matrix.py'.
SEÇENEKLER
İSİMLER: İsimler dosyasının dosya adı; düz metin adları dosyası, başına bir ad içermelidir
hat. Ad, tüm algoritmada tanımlayıcı olarak kullanılır.
-h, --yardım et
bu yardım mesajını göster ve çık
-m SMAT, --benzerlik matrisi=SMAT
Benzerlik matrisi dosyasına giden yol. Benzerlik matrisi aynı formülle oluşturulmalıdır.
NAMES dosyası. [varsayılan: ./similarity_matrix.npy]
-s SAM, --samdosyaları=SAM
Eşleştirici tarafından oluşturulan SAM dosyalarına işaret eden desen. İsim için yer tutucu
"%s". [varsayılan: ./SAM/%s.sam]
-b BOT, --bootstrap-örnekler=BOOT
Önyükleme örneklerinin sayısını ayarlayın. Önyüklemeyi devre dışı bırakmak için 1'i kullanın [varsayılan: 100]
-o DIŞARI, --çıktı=OUT
Sonuçları içeren düz metin çıktı dosyası. [varsayılan: ./results.txt]
onworks.net hizmetlerini kullanarak çevrimiçi olarak Correct_abundances kullanın
