e-PCR - Bulutta Çevrimiçi

Program:

ADI

e-PCR — DNA dizilerinde dizi etiketli siteleri (STS) bulun

SİNOPSİS

e-PCR [-hV] [posix-seçenekleri] sts dosyası [oruç ...] [uyumluluk seçenekleri]

TANIM

Program, genomdaki primer çiftlerinin bulunduğu yerde patlamayı ikame eder.
bir PCR ürünü verir.

SEÇENEKLER

posix seçenekleri şunlardır:

-m=## Marj (varsayılan 50)

-w=## Kelime boyutu (varsayılan 7)

-n=## İzin verilen maksimum uyumsuzluk sayısı (varsayılan 0)

-g=## İzin verilen maksimum indel sayısı (varsayılan 0)

-f=## ## ayrık sözcükler kullanın, eğer ##>1 ise yavaşlayın

-o=## Çıktı dosyasını ayarla

-t=## Çıktı biçimini ayarla:

1 - klasik, aralık (poz1..pos2)

2 - klasik, orta nokta

3 - tablo

4 - yorumlarda hizalamalı tablo (yavaş)

-d=##-## Varsayılan boyut aralığını ayarla (varsayılan 100-350)

-p=+- İsabet sonrası süreci aç/kapat

-v=## Ayrıntı bayrakları

-a=a|f Ön boyut hizalamalarını kullanın (yalnızca boşluklar> 0 ise), yavaş

a - Her zaman veya f - Yedek olarak

-x=+- Primerlerin 5'-uçlu küçük harf maskelemesini kullanın (varsayılan -)

-u=+- Tüm primerleri büyük harfle (varsayılan -)

uyumluluk seçenekleri (yinelenen posix seçenekleri)

M=## Marj (varsayılan 50)

W=## Kelime boyutu (varsayılan 7)

N=## İzin verilen uyumsuzluk sayısı (varsayılan 0)

G=## İzin verilen maksimum indel sayısı (varsayılan 0)

F=## ## süreksiz kelime kullanın

O=## Çıktı dosyasını ## olarak ayarla

T=## Çıktı biçimini ayarla (1..3)

D=##-## Varsayılan boyut aralığını ayarla

P=+- İşlem sonrası isabetleri açık/kapalı

V=## Ayrıntı bayrakları

A=a|f Ön boyut hizalamalarını kullanın (yalnızca boşluklar> 0 ise), yavaş

a - Her zaman veya f - Yedek olarak

X=+- Primerlerin 5'-uçlu küçük harf maskelemesini kullanın (varsayılan -)

U=+- Tüm primerleri büyük harfle (varsayılan -)

-orta T=2 ile aynı

Diğer seçenekler hakkında bilgi almak için aramanız yeterli e-PCR herhangi bir seçenek olmadan.

onworks.net hizmetlerini kullanarak e-PCR'yi çevrimiçi kullanın