Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen glam2scan komutudur.
Program:
ADI
glam2scan - veritabanında bir GLAM2 motifi bulur
SİNOPSİS
glam2scan [seçenekleri] alfabe benim_motifim.glam2 my_seqs.fa
Bunun dışında bir alfabe p or n bir alfabe dosyasının adı olarak yorumlanır.
TANIM
glam2scan tarafından keşfedilen bir motifle bir dizi veri tabanında eşleşmeler bulur. gösteriş2arasında seçim yapmanızı sağlar. Her
maç, motife ne kadar uyduğunu gösteren bir puan alır.
SEÇENEKLER (VARSAYILAN AYARLAR)
-h
Tüm seçenekleri ve bunların varsayılan ayarlarını göster.
-o
Çıktı dosyası (stdout'u).
-n
Raporlanacak hizalama sayısı (25).
-2
Her iki ipliği de inceleyin - ileri ve geri tamamlayıcı.
-D
Silme sözde sayı (0.1).
-E
Silinmeyen sözde sayı (2.0).
-I
Ekleme sözde sayısı (0.02).
-J
Eklemesiz sözde sayı (1.0).
-d
Dirichlet karışım dosyası.
onworks.net hizmetlerini kullanarak glam2scan'i çevrimiçi kullanın
