Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen gmod_fasta2gff3.plp komutudur.
Program:
ADI
$O - FASTA'yı basit GFF3'e dönüştürün
SİNOPSİS
% $O [seçenekler]
KOMUT SATIRI SEÇENEKLER
--fasta_dir Dizin fasta dosyalarını içerir
(varsayılan: ./fasta)
--gfffilename Oluşturulacak GFF3 dosyasının adı
(varsayılan: ./out.gff)
--type SO tipi, her bir özelliğe atanacak
(varsayılan: EST)
--source Metin kaynak sütunda görünecek
(varsayılan: .)
--attributes 9. sütunda görünecek ek etiket=değer çiftleri
--nosequence ##FASTA bölümünü gizleyin (yani,
DNA dizilerini yazdır)
TANIM
Bu komut dosyası sadece bir fasta dosyası koleksiyonu alır ve bunları basit GFF3'e dönüştürür
chado'ya yükleme için uygundur.
YAZARLAR
Scott Cain[e-posta korumalı]>
Telif Hakkı (c) 2006
Bu kütüphane ücretsiz bir yazılımdır; yeniden dağıtabilir ve/veya aynı şekilde değiştirebilirsiniz.
Perl'in kendisi olarak terimler.
onworks.net hizmetlerini kullanarak gmod_fasta2gff3.plp'yi çevrimiçi kullanın
