Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi öykünücüsü veya MAC OS çevrimiçi öykünücüsü gibi birden çok ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen go-show-paths-to-rootp komutudur.
Program:
ADI
go-show-paths-to-root.pl - bir terimden en üste tüm olası yolları gösterir
SİNOPSİS
go-show-paths-to-root.pl -id GO:0008021 ontoloji/gene_ontology.obo
go-show-paths-to-root.pl -names -id GO:0008021 ontoloji/gene_ontology.obo
AÇIKLAMA
köke giden tüm yolları (terimler ve araya giren ilişkiler) gösteren DAG'yi geçer
Bu komut dosyası tamamen dosya tabanlıdır; ontolojiyi her seferinde ayrıştırması gerekiyor
Sonraki ayrıştırmalar, use_cache seçeneği kullanılarak hızlandırılabilir.
GO MySQL db'yi kullanmak istiyorsanız, go-db-show-paths-to-root.pl komut dosyasına bakın.
db-perl dağıtımı
ARGÜMANLAR
-e HATA DOSYASI
XML'de ayrıştırma hatalarını yazar - varsayılan olarak STDERR'dir (kuyuda ayrıştırma hatası olmamalıdır
oluşturulmuş dosyalar)
-p FORMAT
hangi ayrıştırıcının kullanılacağını belirler; belirtilmezse dosyaya göre tahmin yapılır
son ek. Formatlar için aşağıya bakın
-use_cache
Bu anahtar belirtilirse, önbelleğe alma modu açılır.
Önbelleğe alma moduyla, bir dosyayı ilk kez ayrıştırdığınızda, ardından ek bir dosya
ayrıştırılması hızlı olan özel bir biçimde dışa aktarılır. Bu dosya aynı dosya adına sahip olacak
orijinal dosya olarak, ancak ".cache" son ekine sahip olacak.
Dosyayı bir sonraki ayrıştırışınızda, bu program otomatik olarak varlığını kontrol edecektir.
".cache" dosyasının. Varsa ve belirttiğiniz dosyadan daha yeniyse, bu
bunun yerine ayrıştırılır. Mevcut değilse, yeniden inşa edilir.
DOKÜMANTASYON
<http://www.godatabase.org/dev>
onworks.net hizmetlerini kullanarak go-show-paths-to-rootp'u çevrimiçi kullanın
