Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen gt-eval komutudur.
Program:
ADI
gt-eval - Açıklama dosyalarını karşılaştırın ve doğruluk ölçülerini gösterin (tahmin ve referans).
SİNOPSİS
gt değerlendirme referans_dosyası tahmin_dosyası
TANIM
-nuc [evet|hayır]
nükleotid seviyesini değerlendirin (bellek tüketimi, giriş dosyası boyutlarıyla orantılıdır)
(varsayılan: evet)
-ltr [evet|hayır]
bir gen tahmini yerine bir LTR retrotranspozon tahminini değerlendirin (tümü
LTR_retrotransposon öğelerinin belirsiz bir diziye sahip olduğu kabul edilir) (varsayılan:
numara)
-ltrdelta [değer]
LTR sınırlarının eşit sayılması için izin verilen deltayı ayarla (varsayılan: 20)
-v [evet|hayır]
ayrıntılı ol (varsayılan: hayır)
-o [Dosya]
çıktıyı belirtilen dosyaya yönlendir (varsayılan: tanımsız)
-gzip [evet|hayır]
gzip sıkıştırılmış çıktı dosyası yaz (varsayılan: hayır)
-bzip2 [evet|hayır]
bzip2 sıkıştırılmış çıktı dosyası yaz (varsayılan: hayır)
-güç [evet|hayır]
çıktı dosyasına yazmaya zorla (varsayılan: hayır)
-Yardım
yardımı göster ve çık
-version
sürüm bilgilerini göster ve çık
Program, belirli özellik türleri için duyarlılık ve özgüllük değerlerini gösterir (örn.
gen, mRNA ve ekson). Bazı özellik türleri için eksik ve yanlış özelliklerin sayısı
bu tip de gösterilir. Bu nedenle, "eksik", o türden özelliklerin sayısı anlamına gelir.
"tahmin"den bu tür bir özellik ile örtüşmeyen "referans". yardımcısı
tam tersi, "yanlış", "tahmin"den o türdeki özelliklerin sayısını belirtir.
"referans"tan bu türdeki bir özellikle örtüşür.
RAPORLAMA BÖCEK
Hataları şuraya bildir:[e-posta korumalı]>.
onworks.net hizmetlerini kullanarak gt-eval'i çevrimiçi kullanın
