Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan biri kullanılarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen hmm-assembler.pl komutudur.
Program:
ADI
hmm-assembler.pl - SNAP modülü hmm-assembler.pl
SİNOPSİS
hmm-assembler.pl [-SEÇENEKLER [-DAHA FAZLA SEÇENEK]] [--] [PROGRAM_ARG1 ...]
SEÇENEKLER
The takip etme tek karakter seçenekleri vardır kabul edilmiş:
Argümanlarla: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
Boole (argümanlar olmadan): -r -o -x -p -t -1
Seçenekler birleştirilebilir. -- seçeneklerin işlenmesini durdurur. Alan gerekli değil
seçenekler ve argümanları arasında.
Seçenekler:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 [] 3'UTR modelini içerir, gerektirir -a
-a [] PolyA modelini içerir, gerektirir -3
-5 [] 5'UTR moel içerir, gerektirir -p
-p jenerik promotör modelini içerir, gerektirir -5
-r genel tekrar modelini dahil et
-o ters ORF modelini dahil et
-x açık süreli intron modelini kullan
-t C.elegans trans-splicing'i içerir, gerektirir -p, -5
-Z klana özgü değerleri ayarlar (solucan, sinek, bitki)
-1 tek gen modeli
-c
GC-AG ekleme donör modelini içerir
onworks.net hizmetlerini kullanarak hmm-assembler.pl'yi çevrimiçi kullanın
