Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen indigo-deco komutudur.
Program:
ADI
indigo-deco - molekül iskelesi tespiti ve R-grubu dekonvolüsyonu
SİNOPSİS
çivit-deco Dosyaları [parametreler]
çivit-deco -h
TANIM
çivit-deco molekül iskelesi tespiti ve R-grubu dekonvolüsyonu gerçekleştirir. Kabul edilmiş
biçimler şunlardır: Molfile, SDFile, RDFile, SMILES ve CML.
SEÇENEKLER
çivit-deco aşağıdaki parametreleri kabul eder.
-h Yardım mesajını yazdır
-a Yaklaşık iskeleyi hesaplayın (varsayılan kesindir)
-s
Bulunan maksimum iskeleyi molfile'a yaz
-S
Bulunan tüm iskeleleri SD dosyasına yaz
-l
İskele hesaplamayın, dosyadan yükleyin
-sr
Bir dosyaya R-siteleri ile iskele yazın
-o
Ortaya çıkan vurgulanan molekülleri dosyaya yazın
-r
Elde edilen molekülleri ayrılmış r gruplarıyla dosyaya yazın
oluşturulan Aromatik düşünce yok
-- Seçeneklerin sonunu işaretler
ÖRNEKLER
çivit-deco *.mol -o hl.sdf -s scaf.sdf
Geçerli dizindeki mol dosyalarından molekülleri okuyun, bulunan maksimum iskeleyi kaydedin
scaf.mol'e ve vurgulanan molekülleri hl.sdf'ye kaydedin.
çivit-deco yapı.mol birçok.sdf -s scaf.mol -S allscafs.sdf -r rg.sdf
Structure.mol'den bir molekül ve many.sdf'den birden fazla molekül okuyun, kaydedin
r-r gruplarına sahip molekülleri rg.sdf'ye kopyalayın ve bulunan tüm iskeleleri allscafs.sdf'ye kaydedin.
çivit-deco *.smı -d Readyscaf.mol -o hl.sdf
Geçerli dizindeki her SMILES dosyasından birden fazla molekülü okuyun, okuyun
Readyscaf.mol'den iskele yapın ve vurgulanan molekülleri hl.sdf'ye kaydedin.
onworks.net hizmetlerini kullanarak indigo-deco'yu çevrimiçi kullanın
