Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen LAshow komutudur.
Program:
ADI
LAshow - .las dosyalarından yerel hizalamaları göster
SİNOPSİS
LA gösterisi [-karoUF] [-iint(4)] [-wint(100)][-bint(10)] kaynak1:db|baraj [kaynak2:db|baraj] hizala:las
[okur:DOSYA | okur:aralık ... ]
TANIM
LA gösterisi belirtilen .las'ta bulunan yerel hizalamaların basılı bir listesini üretir
a- ve b-okumalarının geldiği dosya src1 veya gelen src1 ve src2, sırasıyla. Eğer bir
dosya veya okuma aralıklarının listesi verilir, ardından yalnızca a-okumanın bulunduğu örtüşmeler
dosya veya liste tarafından belirtilen küme görüntülenir. Görmek DB gösterisi(1) bir açıklama için
dosya ve okuma aralıkları listesinin nasıl yorumlandığı.
SEÇENEKLER
-F Ekrandaki a- ve b- okumalarının rollerini tersine çevirin
-U DNA dizisi için varsayılan küçük harf yerine büyük harf kullanın
-igirinti
İstenirse, çizgi ve/veya hizalama ekranları için girintiyi ayarlayın.
(varsayılan: 4)
-bsembol_sayısı
Hizalanmış bölümlerin her iki tarafındaki sembollerin sayısını bir hizalamada ayarlayın
Görüntüle. (varsayılan: 10)
-ww Bu parametre, tarafından belirtilen görüntüleme modları için kullanılır. -a ve -r. (varsayılan:
100)
-o Yalnızca uygun örtüşen hizalamaları görüntüleyin - yani bir dizinin bittiği yerde
hizalamanın her bir ucunda gerçekleşir
EKRAN MODLARI
-c Hizalamanın çizgi film gösterimi
-A, -r Yerel hizalamanın hizalamasını görüntüle
The -a seçenek tam olarak koyar w ekranın segmenti başına sütunlar, oysa -r seçenek
tam olarak koyar w a-ekranın her bölümündeki sembolleri okuyun. NS -r görüntüleme modu
aynı a-okumayı içeren iki hizalamayı görsel olarak karşılaştırmak istendiğinde kullanışlıdır. Eğer bir
kombinasyonu -c, -a, ve -r bayraklar kurulur, sonra çizgi film önce gelir, sonra -a
hizalama ve son olarak -r hizalaması.
onworks.net hizmetlerini kullanarak LAshow'u çevrimiçi kullanın
