Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen load_genbankp komutudur.
Program:
ADI
load_genbank.pl - GENBANK dosyalarından bir Bio::DB::GFF veritabanı yükleyin.
SİNOPSİS
% load_genbank.pl -d genbank -f localfile.gb
% load_genbank.pl -d genbank -a AP003256
NOT: BioPerl dağıtımındaki bp_genbank2gff.pl betiği bu betik ile aynıdır.
TANIM
Bu komut dosyası, yerel veya yerel bir dosyada bulunan özelliklere sahip bir Bio::DB::GFF veritabanı yükler.
genbank dosyası veya genbank'tan alınan bir erişim. Çeşitli komut satırı seçenekleri
hangi veritabanının yükleneceğini ve mevcut bir veritabanının yüklenmesine izin verilip verilmeyeceğini kontrol etmenizi sağlar.
üzerine yazılabilir.
Bu komut dosyası şu anda yalnızca MySQL kullanıyor, ancak bu bir ilke kanıtıdır ve kolayca olabilir.
adaptörler aracılığıyla GFF tarafından desteklenen diğer RDMS ile çalışacak şekilde genişletilebilir.
KOMUT SATIRI SEÇENEKLER
Komut satırı seçenekleri, tek harfli seçenekler olarak kısaltılabilir. örneğin -d yerine
--veri tabanı.
--create Veritabanının oluşturulmasını ve başlatılmasını sağlar
--dsn Veri kaynağı (varsayılan dbi:mysql:test)
--kullanıcı MySQL kimlik doğrulaması için kullanıcı adı
--geçmek MySQL kimlik doğrulaması için parola
--proxy Uzaktan erişim için kullanılacak proxy sunucusu
--file Argümanlar Genbank/EMBL dosya adlarıdır (varsayılan)
--accession Argümanlar genbank erişim numaralarıdır
--stdout Dönüştürülen GFF dosyasını yüklemek yerine stdout'a yazın
onworks.net hizmetlerini kullanarak load_genbankp'i çevrimiçi kullanın
