Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen mirabait komutudur.
Program:
ADI
mirabait - bir okuma koleksiyonundan okumaları seçin
SİNOPSİS
mirabayt [-f ] [-t [-T ...]] [-iklor] yem dosyası dosyası
TANIM
mirabayt kısmen benzer veya eşit olan bir okuma koleksiyonundan okumaları seçer
hedef yemler olarak tanımlanan diziler. Benzerlik, kullanıcı tarafından ayarlanabilen bir
yemde aynı olan ortak k-merlerin sayısı (k ardışık baz dizileri)
diziler ve seçilecek taranan diziler, ileri veya geri
tamamlayıcı yön.
SEÇENEKLER
-f
bu tür proje dosyalarını yükleyin, burada fromtype:
CAF'den caf dizileri
MAF'tan maf dizileri
bir doktoradan doktora dizileri
bir GBF'den gbf dizileri
bir FASTA'dan fasta dizileri
bir FASTQ'dan fastq dizileri
-t
dizileri bu türe yazın (birden çok söz -t izin verilir):
FASTA'ya fasta dizileri
fastq dizileri için FASTQ
CAF için caf dizileri
MAF için maf dizileri
metin dosyasına txt sıra adları
-k k-mer, bazlarda yem uzunluğu (<32, varsayılan=31)
-n Min. gereken k-mer yem sayısı (varsayılan=1)
-i Ters vuruş: sadece yemi vurmayan dizileri yazar
-r Ters tamamlayıcı yönünün kontrolü yok
-o fastq kalite Ofset (yalnızca -f = 'fastq') FASTQ'da kalite değerlerinin ofseti
dosya. Varsayılan: 33 0 değeri otomatik olarak tanınmaya çalışır.
-f
bu tür proje dosyalarını yükleyin, burada fromtype:
CAF'den caf dizileri
MAF'tan maf dizileri
bir doktoradan doktora dizileri
bir GBF'den gbf dizileri
bir FASTA'dan fasta dizileri
bir FASTQ'dan fastq dizileri
-t
dizileri bu türe yazın (birden çok söz -t izin verilir):
FASTA'ya fasta dizileri
fastq dizileri için FASTQ
CAF için caf dizileri
MAF için maf dizileri
metin dosyasına txt sıra adları
-k k-mer, bazlarda yem uzunluğu (<32, varsayılan=31)
-n Min. gereken k-mer yem sayısı (varsayılan=1)
-i Ters vuruş: sadece yemi vurmayan dizileri yazar
-r Ters tamamlayıcı yönünün kontrolü yok
-o fastq kalite Ofset (yalnızca -f = 'fastq') FASTQ'da kalite değerlerinin ofseti
dosya. Varsayılan: 33 0 değeri otomatik olarak tanınmaya çalışır.
onworks.net hizmetlerini kullanarak mirabait'i çevrimiçi kullanın
