Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi öykünücüsü veya MAC OS çevrimiçi öykünücüsü gibi birden çok ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen vcf-query komutudur.
Program:
ADI
vcf-query - VCF dosyalarını sorgula
SİNOPSİS
sorgu-vcf [SEÇENEKLER] dosya.vcf.gz
SEÇENEKLER
-c, --sütunlar
Virgülle ayrılmış sütun adlarının listesi.
-f, --biçim
Varsayılan '%CHROM:%POS\t%REF[\t%SAMPLE=%GT]\n' şeklindedir.
-l, --list-sütunlar
Sütunları listeleyin.
-r, --bölge chr:baştan sona
Bölgeyi alın. (Tabix'i çalıştırır.)
-h- ?, --yardım et
Bu yardım mesajı.
ÖRNEKLER
sorgu-vcf dosyası.vcf.gz 1:1000-2000 -c NA001,NA002,NA003 sorgu-vcf dosyası.vcf.gz -r
1: 1000-2000 -f '%CHROM:%POS\t%REF[\t%SAMPLE:%*=,]\n' sorgu-vcf dosyası.vcf.gz -f
'[%GT\t]%LINE\n' sorgusu-vcf dosyası.vcf.gz -f '%CHROM\t%POS\t%BILGI/DP\t%FILTER\n'
onworks.net hizmetlerini kullanarak vcf sorgusunu çevrimiçi kullanın
