Bu, en son sürümü barracuda_0.7.107h.tar.gz olarak indirilebilen BarraCUDA Fast Short Read Aligner adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
BarraCUDA Fast Short Read Aligner adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
BarraCUDA Hızlı Kısa Okuma Hizalayıcı
TANIM
Barracuda, Sanger'in BWA'sına dayanan yüksek hızlı bir dizi hizalayıcıdır ve yeni nesil diziciler tarafından oluşturulan dizi okumalarının hizalanmasını hızlandırmak için en son Nvidia CUDA mimarisini kullanır.
Özellikler
- Ubuntu 16.04'te yazılımın derlenmesiyle ilgili sorunlar düzeltildi
- İnce ayar: SAMPE 8 çekirdek sınırı artık kaldırıldı
- NVIDIA CUDA hızlandırmasını kullanarak FM dizini sıralama okuma eşleyici yazılımı
- Aşağı akış analizleri için SAM formatında çıktılar
- 3.5 veya üzeri bilgi işlem kapasitesine sahip NVIDIA grafik kartı ve en az 1 GB VRAM gerektirir
- NVIDIA CUDA SDK araç takımı 6.x veya üzeri ve NVIDIA sürücüsü 340 veya üzeri gerektirir
- BarraCUDA, BMC Research Notes 2012, 5:27, doi:10.1186/1756-0500-5-27'de yayınlandı
- Kağıt URL'si: http://www.biomedcentral.com/1756-0500/5/27
- Bu proje, Cambridge Üniversitesi'ndeki CUDA mükemmellik merkezi tarafından desteklenmektedir.
Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
C++, C
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/seqbarracuda/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
