Bu, en son sürümü bspipe-1.3.zip olarak indirilebilen bspipe adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile bspipe adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak ücretsiz indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
spipe
Ad
AÇIKLAMA
BSpipe, dizi kalite kontrolünden ve haritalamadan diferansiyel olarak metillenmiş bölgelerin fonksiyonel analizine kadar kapsamlı bir boru hattıdır:
(1) sıralama kalite değerlendirmesi,
(2) sıra temizleme,
(3) dizi okuma eşlemesi,
(4) metilasyon miktar tayini,
(4) metilasyon profiline dayalı numune karşılaştırmaları,
(5) DMR'lerin tanımlanması (farklı olarak metillenmiş bölgeler),
(6) DMR'lerin açıklaması,
(7) diferansiyel olarak metillenmiş genlerin fonksiyonel analizi,
(8) görselleştirme için girdi dosyalarının oluşturulması ve
(9) TAB-seq, OxBS-seq, MAP-it ve NOMe-seq gibi gelişmiş sıralama teknolojileri için destek.
Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
Unix Kabuk, Perl, S/R
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/bspipe/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
