Bu, en son sürümü cloudclientID.zip olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalışacak ChIP-RNA-seqPRO adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için ChIP-RNA-seqPRO adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
ChIP-RNA-seqPRO Linux'ta çevrimiçi çalışacak
AÇIKLAMA
ChIP-RNA-seqPRO: Anormal transkript ekleme ve RNA düzenleme siteleri ile ilişkili epigenetik kuralsızlaştırma bölgelerini belirlemek için bir strateji. Özelleştirilmiş açıklama kitaplıkları, demo veri girişi ve BENİOKU kılavuzu ile birlikte paketlenmiş çalıştırılabilir python komut dosyaları.9/26 : v1.1 MAIN_IV, artık 'alt küme'yi desteklemeyen piton pandalar tarafından oluşturulan hata ayıklamak için güncellendi.
Bu kod artık burada aktif olarak korunmayacak/güncellenmeyecek. Epigenetik, dizi varyasyonu ve ifade veri kümelerinin karşılaştırmalı analizi için bulut tabanlı bir kaynak artık mevcuttur. Lütfen bulut tabanlı kaynaklar projesi olan Cloudomics'i ziyaret edin: https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
Özellikler
- Çok çeşitli epigenomik (ChIPseq, MBDseq, vb.) ve RNA tabanlı dizileme eşleştirilmiş örnek veri kümelerinin karşılaştırmalı analizi için araç
- Bu aracı veya açıklama kitaplıklarından herhangi birini kullanıyorsanız lütfen aşağıdaki referansı ekleyin: Champion M., Hlady R., Yan H., Evans J., Nie J., Lee J., Bogenberger J., Nandakumar K., Davila J., Moore R., Nair A., O'Brien D., Zhu Y., Kortüm K., Ordog T., Zhang Z., Joseph R., Kocher J., Jonasch E., Robertson K., Tibes R. ve H. Ho T. (2015). Aberrant Transkript Ekleme ve RNA-düzenleme ile İlişkili Epigenetik Deregülasyon Bölgelerini Tanımlamak için Biyoinformatik Stratejileri. Uluslararası Biyoinformatik Modeller, Yöntemler ve Algoritmalar Konferansı Bildirilerinde, sayfa 163-170. DOI: 10.5220/0005248001630170
Seyirci
Bilim araştırması
Programlama dili
Unix Kabuk, Python
Bu, https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
