Bu, en son sürümü cstone.zip olarak indirilebilen CStone adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
CStone adlı bu uygulamayı OnWorks ile çevrimiçi olarak ücretsiz indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
CSstone
TANIM
CStone, RNA-Seq verileri için de Bruijn benzeri grafikler kullanan ve kimerik olmamasının garanti edilip edilemeyeceğini gösteren üç grafik sınıflandırma seviyesinden biri ile üretilen her bir bitişikliğe açıklama ekleyen de novo bir derleyicidir. Sınıflandırma seviyeleri, okumaların türetildiği gen ailesinin karmaşıklığına bağlıdır. Bir yan ürün olarak, bu aynı zamanda sekanslanmış altta yatan gen ailelerinin yapısal yapısı hakkında bilgi sağlar. Daha fazla ayrıntı kısa süre içinde makalemizde yer alacaktır: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
Özellikler
- RNA-Seq verilerinin de novo montajı.
- Kimerik olmayan contig'lerin tanımlanması.
- Platformlar arası uyumluluk.
- Yürütülebilir kavanoz mevcut.
- Harici paket gerekmez.
- Takip etmesi kolay ve diğer araçlara dahil edilmiş kod.
- Altta yatan gen ailelerinin karmaşıklığı hakkında bilgi.
- de Bruijn benzeri (daha yumuşak) bir yaklaşım.
Bu, https://sourceforge.net/projects/cstone/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
