Bu, en son sürümü Grinder-0.5.4.tar.gz olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalışacak Grinder adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için Grinder adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
Öğütücü çevrimiçi Linux'ta çalışacak
Ad
TANIM
Öğütücü, tüm ana sıralama platformları için simüle edilmiş omik av tüfeği ve amplikon dizi kitaplıkları oluşturmak için çok yönlü bir açık kaynaklı biyoinformatik araçtır.Özellikler
- av tüfeği veya amplikon (örn. 16S rRNA) kitaplıkları okur
- genomik, transkriptomik, proteomik, metagenomik, metatranskriptomik veya metaproteomik veri kümeleri oluşturmak için omik desteği
- keyfi okuma uzunluğu dağılımı ve okuma sayısı
- PCR simülasyonu ve sıralama hataları (kimeralar, nokta mutasyonları, homopolimerler)
- eşleştirilmiş uç (eş çifti) veri kümeleri için destek
- her genom, gen veya protein için belirli sıralama bolluğu ayarları veya manuel olarak verilen bolluk
- belirli bir zenginliğe sahip veri kümelerinin oluşturulması (alfa çeşitliliği)
- ilgili veri kümeleri değişken sayıda genomu paylaşabilir (beta çeşitliliği)
- değişen genom uzunlukları veya gen kopya sayısı tarafından yaratılan yanlılığın modellenmesi
- tercih edilen seçenekleri saklamak için profil mekanizması
- çoklu arayüzler aracılığıyla biyologlar veya ileri düzey kullanıcılar tarafından kullanılabilir: GUI, CLI ve API
Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
Konsol/Terminal
Programlama dili
Perl
Bu, https://sourceforge.net/projects/biogrinder/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
