Bu, en son sürümü LocusVu.tar.gz olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalışacak locusvu adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için locusvu adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
locusvu çevrimiçi Linux'ta çalışacak
TANIM
LocusVu, genomik lokusların (kromozom üzerindeki konumlar) bir listesini girdi olarak kabul eden ve UCSC genom tarayıcısı gibi genel veri tabanlarından ilgili bilgilerin (sitogenetik bant, gen adı, OMIM verileri vb.) getirilmesini otomatikleştiren Java tabanlı yeni bir yazılım aracıdır. veri tabanı. Daha sonra, birden fazla veri kümesini karşılaştırmak (karşılaştırmalı genomik), aracın içinden bir lokus için komşu genleri görüntülemek veya bu sonuçları çubuk / pasta grafiklerde grafik olarak temsil etmek gibi, alınan sonuçlar üzerinde birden fazla iş akışı sağlar. LocusVu'nun ön yüzünde, temel mantıkla sezgisel kullanıcı etkileşimi sağlayan basit, kullanımı kolay bir GUI vardır.Araç, diğer veritabanları (örn. Ensembl) için destek eklemek veya bilgi almak için kolayca genişletilebilir.
veritabanındaki diğer tablolardan. Böylece LocusVu, hem kullanıcılar hem de geliştiriciler tarafından mevcut iş akışlarını basitleştirmede ve genomikte veri analizini desteklemek için daha yenilerini oluşturmada kullanılabilecek temel bir çerçeve sağlar.
Özellikler
- Veritabanlarından veri alımını otomatikleştirir (şu anda UCSC genom tarayıcı veritabanı)
- gibi alınan sonuçlar üzerinde iş akışlarını etkinleştirir.
- ..birden çok veri setini karşılaştırma (karşılaştırmalı genomik)
- ..bir lokus için komşu genleri görüntüleyin (aracın içinden)
- ..sonuçları grafiksel olarak temsil eder (çubuk / pasta grafikler)
- Sezgisel kullanım için ön uçta kullanımı kolay GUI
- Kolay hata ayıklama için Log4j ile günlüğe kaydetme
- Kolayca genişletilebilir
Seyirci
Bilim/Araştırma, Geliştiriciler
Kullanıcı arabirimi
Java Salıncak
Programlama dili
Java
Veritabanı Ortamı
MySQL
Bu, https://sourceforge.net/projects/locusvu/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
