Bu, en son sürümü muda.pl-v3.6.zip olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalıştırılmak üzere MANTI.pl / muda.pl adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
MANTI.pl / muda.pl adlı bu uygulamayı Linux'ta OnWorks ile ücretsiz olarak çevrimiçi çalıştırmak için indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
MANTI.pl / muda.pl Linux'ta çevrimiçi çalışacak
AÇIKLAMA
-------- DİKKAT BAŞLANGIÇ: YENİDEN ADLANDIRMAmuda.pl v3.7 ile MANTI.pl olarak yeniden adlandırıldı, proje geliştirme aşağıdaki MANTI proje sayfasından takip edilebilir: sourceforge.net. Eski sürümler arşiv amacıyla burada kalır.
-------- DİKKAT SONU
muda.pl, büyük bağımlılıkları olmayan bir değerlendirme betiğidir (Perl'de yazılmıştır).
4 farklı MaxQuant çıktı dosyasındaki bilgileri, protein neo-termini analizleri için açıkça uygun bir ana dosyada toplar. Veri topluluğu için merkezi çapa, modifikasyonSpecificPeptides.txt dosyasıdır - ek veriler, MaxQuant txt klasöründeki diğer farklı kaynak dosyalardan çıkarılır, ancak veri derlemesinin başlangıç noktası yalnızca modifikasyonSpecificPeptides.txt dosyasıdır. Belki normal proteomik amaçlar için de yararlıdır, ancak bu komut dosyası, protein neo-termini tanımlama ve doğrulama için yoğun şekilde optimize edilmiştir.
Komut dosyası parametrelerinin ve değerlendirme stratejisinin daha kapsamlı bir açıklaması için lütfen kapsamlı kılavuz PDF'ye bakın.
Özellikler
- MaxQuant veri değerlendirmesi
- Protein-Termini tanımlama ve doğrulama
- UniProt veri açıklaması ve montajı
- Tanımlanmış Termini'nin İzoformlara yeniden eşlenmesi
- Limma, LOCALIZER & TopFINDer entegrasyonu
- İyi belgelenmiş
Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
Perl
Bu, https://sourceforge.net/projects/muda/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
