Bu, en son sürümü meta_phat.tar.gz olarak indirilebilen MetaPhat -meta-pheno-association-tracker adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile MetaPhat -meta-feno-association-tracker adlı bu uygulamayı ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
MetaPhat -meta-feno-ilişkilendirme-izleyici
TANIM
MetaPhat, tek değişkenli GWAS çalışmalarından alınan özet istatistikleri kullanarak çok değişkenli ilişkilendirmelere sahip değişkenleri tespit etmeye yönelik aktif ve açık kaynaklı (MIT lisansı) bir araçtır. Uygulama ayrıca, çok değişkenli müşteri adayı varyantları için optimal BIC alt kümelerini ve P-değeri sürücü özelliklerini bularak ayrıştırma gerçekleştirir. Varyant sonuçları, fenotipler-genotip ilişkilerinin kesilmesine yardımcı olmak için izlenir ve kümelenir.Kurulum talimatları, gerekli GWAS veri biçimleri ve test komutuyla örnek girişler için lütfen wiki ana sayfamıza bakın - https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
Global lipidler (GLGC, Willer 2013) veri/kaynak katran örneği - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Örneği denedikten ve öğreticiyi okuduktan sonra sorun yaşarsanız veya özellik istekleriniz varsa, lütfen e-posta gönderin: [e-posta korumalı]
Telif hakkı <2019> [e-posta korumalı], [e-posta korumalı]
Özellikler
- çok değişkenli genom çapında özellik analizi
- p-değeri ve BIC tabanlı optimal özellik alt kümesi seçimi
- özellik ayrıştırma iz grafikleri
- kurşun SNP ve sürücü özelliği özet dosyası
- snp-snp özellik sıralaması mızrakçı kümesi
Bu, https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
