Bu, en son sürümü metaSort.tar.gz olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalıştırılacak metasort adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için metasort adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
Linux'ta çevrimiçi çalışacak metasort
AÇIKLAMA
Güncel yaklaşımların çoğu, referans genomların katılımıyla metagenomik verileri analiz eder. Bununla birlikte, yeni mikrobiyal topluluklar, referans veritabanlarının kapsamının çok ötesine uzanır ve karmaşık mikrobiyal topluluklardan de novo metagenom derlemesi hala büyük bir zorluk olmaya devam etmektedir. Burada metagenomik örneklerden bakteri genomlarının etkili bir şekilde oluşturulması için yeni bir deneysel ve biyoinformatik çerçeve olan metaSort'u sunuyoruz. MetaSort, akış sitometrisi ve tek hücreli sıralama metodolojilerine dayanan sıralı bir mini metagenom yaklaşımı sağlar ve orijinal metagenomun tamamlayıcısı ile sıralanmış mini metagenomdan yüksek kaliteli genomları verimli bir şekilde kurtarmak için yeni hesaplama algoritmaları kullanır. Simüle edilmiş veri seti, tükürük ve bağırsak mikrobiyomları üzerinde kapsamlı değerlendirmeler yoluyla, metaSort'un genom kurtarma ve birleştirmede mükemmel ve tarafsız bir performansa sahip olduğunu gösterdik.Bu, https://sourceforge.net/projects/metasort/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
