Bu, en son sürümü QuRe_v0.99971.zip olarak indirilebilen qure adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
qure adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
soru
TANIM
QuRe, özellikle uzun okunan (>100 bp) NGS verilerini analiz etmek için geliştirilmiş, viral yarı türlerin yeniden yapılandırılmasına yönelik bir programdır. Yazılım, bir referans genoma karşı dizi parçalarının hizalanmasını gerçekleştirir, kapsama ve çeşitliliğe dayalı olarak genomun kayan pencerelere optimal bir bölünmesini bulur ve bir buluşsal yöntem kullanarak viral yarı türlerin tüm bireysel dizilerini - prevalanslarıyla birlikte - yeniden oluşturmaya çalışır. genom bölümü boyunca örtüşen farklı viral varyantların çok terimli dağılımlarını eşleştiren algoritma. QuRe, her ikisi de homopolimerik ve homopolimer olmayan bölgelerde verilen hata oranlarına göre parametrelendirilen yerleşik bir Poisson hata düzeltme yöntemi ve yeniden yapılandırma sonrası olasılıklı kümeleme ile birlikte gelir.Bu, https://sourceforge.net/projects/qure/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.