Bu, en son sürümü RGAAT.tar.gz olarak indirilebilen RGAAT adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile RGAAT adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak ücretsiz indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
RGAAT
TANIM
Bu program, dizi hizalama dosyası (SAM veya BAM formatı), dizi varyant dosyası (VCF formatı veya beş sütun tablosu (sekmeyle ayrılmış, kromozom, konum, id, referans dahil) kullanarak yeni genom ve bilinen genom yükseltmesi için genomu bir araya getirebilir ve/veya açıklama ekleyebilir. alel ve alternatif alel)) veya referans genom dizisi dosyasına (FASTA formatı) ve açıklama dosyasına (TBL, GTF, GFF, GFF3 veya BED formatı) dayalı yeni genom dizisi dosyası (FASTA formatı).
Özellikler
- dizi varyasyon tanımlama
- genom konsensüs dizisi oluşturma
- genom modifikasyonu
- genom karşılaştırması
- genom açıklaması
- farklı genom derleme sürümleri arasında genom koordinat dönüşümü oluşturma
Seyirci
Bilim araştırması
Programlama dili
Perl
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/rgaat/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.