Bu, en son sürümü subread-2.0.4-Windows-x86_64.tar.gz olarak indirilebilen Subread adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile Subread adlı bu uygulamayı ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
alt okuma
Ad
AÇIKLAMA
Subread yazılım paketi, yeni nesil sıralama verilerini işlemek için bir araç takımıdır. Subread aligner, Subjunc ekzon-ekson bağlantı dedektörü ve featureCounts okuma özetleme programını içerir.
Alt okuma hizalayıcı, hem gDNA-seq hem de RNA-seq okumalarını hizalamak için kullanılabilir. Subjunc aligner, ekzon-ekson birleşiminin tespiti için tasarlanmıştır. RNA-seq okumalarının eşlenmesi için Subread, yerel hizalamalar gerçekleştirir ve Subjunc, küresel hizalamalar gerçekleştirir. Subread ve Subjunc şu gazetede yayınlandı: Yang Liao, Gordon K Smyth ve Wei Shi. "Alt okuma hizalayıcı: tohum ve oy ile hızlı, doğru ve ölçeklenebilir okuma eşlemesi", Nucleic Acids Research, 2013, 41(10):e108
Özellikler
- hizalayıcı oku
- Yeni nesil sıralama
Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
C
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/subread/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
