Bu, en son sürümü WindowsDockerTG.1.8.1.zip olarak indirilebilen TagGraph adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile TagGraph adlı bu uygulamayı ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
EtiketGrafik
TANIM
Kütle spektrometrisi, binlerce potansiyel protein translasyon sonrası modifikasyonunu (PTM'ler) tanımlamak için çok uygun olmasına rağmen, tarihsel olarak sadece birkaçına karşı önyargılı olmuştur. Çeşitli proteomlarda tüm PTM setini ölçmek için yazılım, muazzam arama alanlarını kapsama ve doğru spektrum yorumlarını yanlış spektrum yorumlarından ayırt etme gibi ikili zorlukların üstesinden gelmelidir. Burada, mevcut yaklaşımlardan 350 kat daha hızlı olan sınırsız dizi tabanlı arama yöntemiyle her iki zorluğun da üstesinden gelen bir hesaplama aracı olan TagGraph'ı ve PTM atamaları için optimize ettiğimiz olasılıklı bir doğrulama modelini açıklıyoruz. TagGraph'ı, 25 milyon kütle spektrumundan oluşan yayınlanmış bir insan proteomik veri setine ve orijinal analizine kıyasla üçe katlanmış kendinden emin spektrum tanımlamalarına uyguladık. Proteomda yaklaşık 1 milyon sitede binlerce modifikasyon türü belirledik.Özellikler
- dize ile karmaşık proteomları tanımlama
Seyirci
Eğitim
Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
Python
Bu, https://sourceforge.net/projects/taggraph/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
