Bu, en son sürümü UniPyRangeSuite.py olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalışacak UniPyRange adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için UniPyRange adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
UniPyRange Linux'ta çevrimiçi çalışacak
TANIM
Uniprot ve NCBI RefSeq Veritabanından (1, 2) fasta dosyalarındaki amino asitleri/DNA bazlarını sayma zahmetinden sizi kurtaran çok basit python betiği.128 amino asitlik bir proteinden 387-1000 aralığındaki amino asit dizisini istediğinizi varsayalım - bu komut dosyası size sadece amino asitlerde belirtilen diziyi göstererek ve DNA baz çiftlerini kodlayarak (amplifikasyon primer tasarımı için ideal) sayım hatalarından kaçınmanıza yardımcı olacaktır. ) belirtilen bir Uniprot Kimliği.
- BioPython (3) ve Bioservices Paketi (4) gerektirir
(1)
UniProt Konsorsiyumu
UniProt: protein bilgileri için bir merkez
Nükleik Asitler Araş. 43: D204-D212 (2015).
(2)
RefSeq: memeli referans dizileri üzerine bir güncelleme. Nükleik Asitler Araş. 2014 Ocak 1;42(1):D756-63.
(3)
Horoz PJ ve ark. Biyoinformatik (2009)
(4)
Cokelaer ve diğerleri, Biyoinformatik (2013)
Programlama dili
Python
Bu, https://sourceforge.net/projects/unipyrange/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.