Bu, en son sürümü wellmeth-1.0.tar.gz olarak indirilebilen, Linux'ta çevrimiçi olarak çalışacak WellMeth adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile ücretsiz olarak Linux'ta çalıştırmak için WellMeth adlı bu uygulamayı çevrimiçi indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
WellMeth çevrimiçi olarak Linux'ta çalışacak
Ad
TANIM
WellMeth, Azaltılmış Temsil Bisülfit-Seq analizi için entegre bir çerçevedirÖzellikler
- Genomik DNA'da metillenmiş sitozinlerin saptanmasına yönelik Dizileme (GBS) yaklaşımını genişletir
- Yüksek kaliteli referans genomların mevcudiyetine dayanır ve kütüphane yapımı için iki metilasyona duyarsız enzimle çift kısıtlamalı sindirim önerilir
- Çift uçlu kısa okuma sıralama için asimetrik ileri ve geri adaptörler, 4 ila 6 nt uzunluğunda barkodlar ve barkodlara bitişik sabit sayıda rastgele nükleotid (Benzersiz Moleküler Tanımlayıcılar, UMI'ler) ile uygulanacaktır.
- UMI bilgileri, PCR kopyalarının hizalama sonrası tanımlanması için kullanılacaktır.
- Dört bindirme modülünden oluşur: Ön işleme, Haritalama, Metilasyon varyantı algılama ve Diferansiyel metilasyon
- Modüller, tam otomatik yürütmeye izin veren özelleştirilebilir sarmalayıcı komut dosyalarıyla birbirine bağlanır
- Hızlı, doğru ve hafif
Kullanıcı arabirimi
Konsol/Terminal
Bu, https://sourceforge.net/projects/wellmeth/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
