Bu, en son sürümü scaffold_builder_v2.2.zip olarak indirilebilen Scaffold_Builder adlı Windows uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
Scaffold_Builder adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden herhangi bir OS OnWorks çevrimiçi öykünücüsünü başlatın, ancak daha iyi Windows çevrimiçi öykünücüsü.
- 5. Yeni başlattığınız OnWorks Windows işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin ve kurun.
- 7. Wine'ı Linux dağıtımları yazılım havuzlarınızdan indirin. Kurulduktan sonra, Wine ile çalıştırmak için uygulamaya çift tıklayabilirsiniz. Ayrıca, popüler Windows programlarını ve oyunlarını yüklemenize yardımcı olacak Wine üzerinden gösterişli bir arayüz olan PlayOnLinux'u da deneyebilirsiniz.
Wine, Windows yazılımını Linux üzerinde çalıştırmanın bir yoludur, ancak Windows gerektirmez. Wine, Windows programlarını doğrudan herhangi bir Linux masaüstünde çalıştırabilen açık kaynaklı bir Windows uyumluluk katmanıdır. Esasen Wine, Windows'a ihtiyaç duymadan tüm bu Windows uygulamalarını çalıştırabilmesi için yeterince Windows'u sıfırdan yeniden uygulamaya çalışıyor.
EKRAN
Ad
İskele Yapıcısı
TANIM
Scaffold_builder, bir referans dizisi boyunca taslak dizileme ile oluşturulan contig'leri sipariş eden bir yazılımdır. Boşluklar N'lerle doldurulur ve küçük örtüşmeler Needleman-Wunsch algoritması ve IUPAC kodlarıyla oluşturulan fikir birliği ile hizalanır. Scaffold_builder, neyin eksik olduğunu ortaya çıkararak ve bu boşlukları kapatmak için hedeflenen dizilemeye izin vererek genomların birleştirilmesine ve açıklanmasına yardımcı olabilir.(c) Silva GG, Dutilh BE, Matthews TD, Elkins K, Schmieder R, Dinsdale EA, Edwards RA.
Lütfen alıntı yapın: "Scaffold_builder ile de novo ve referans kılavuzlu montajı birleştirme", Source Code for Biology and Medicine 2013.
Özellikler
- iskele
- taslak genom
- biyoinformatik
Kullanıcı arabirimi
Web tabanlı, Komut satırı
Programlama dili
Python
Bu, https://sourceforge.net/projects/scaffold-b/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
