Це команда arden-analyze, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS.
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
arden-analyze - аналізувати результати штучного еталонного картування геному
СИНТАКСИС
arden-аналіз [опції] [ВХІД Фото] [ВИХІДНА ПАПКА] ...
ОПИС
Скрипт для аналізу результатів штучного еталонного картування геному. Цей сценарій
ідентифікує передбачувані TP / FP на певному наборі даних (читання).
ВАРІАНТИ
ВИХІДНА ПАПКА
шлях до вихідної цільової папки.
ВХІД Фото
ppath до файлу ini. Щоб отримати необхідний формат, перегляньте файли-приклади.
-- версія
показати номер версії програми та вийти
-h, --допомога
показати це повідомлення довідки та вийти
-p PHRED, --фред=PHRED
Вкажіть кодування PHRED вхідних читань, тобто Illumina 1.3+ = -p 33.[за замовчуванням:
33]
-r РАНГ, -- внутрішній ранг=RANK
Використовуйте внутрішнє рейтингування для читань (потрібно, якщо прочитані імена не можуть бути
лексикографічно сортувати так само в python та у вашій ОС за sam
інструменти).[за замовчуванням:1]
Використовуйте arden-analyze онлайн за допомогою служб onworks.net
