Це команда dbifastae, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
dbifasta - Індексує базу даних файлів fasta
СИНТАКСИС
dbifasta -dbname рядок -idformat список - довідник каталог -імена файлів рядок
-звільнення рядок -дата рядок - поля список - виключити рядок -maxindex ціле
-сортування рядок -системний сорт boolean -прибирати boolean - вихідний файл вихідний файл
-indexoutdir outdir
dbifasta -допомога
ОПИС
dbifasta — це програма командного рядка від EMBOSS («Європейська молекулярна біологія Open
Пакет програмного забезпечення»). Він є частиною командної групи "Utils:Індексація бази даних".
ВАРІАНТИ
вхід розділ
-dbname рядок
-idformat список
Значення за замовчуванням: idacc
- довідник каталог
Значення за замовчуванням: .
-імена файлів рядок
Значення за замовчуванням: *.dat
Вимагається розділ
-звільнення рядок
Значення за замовчуванням: 0.0
-дата рядок
Значення за замовчуванням: 00/00/00
Advanced розділ
- поля список
Значення за замовчуванням: зг
- виключити рядок
-maxindex ціле
-сортування рядок
Параметри сортування, як правило, '-T .' використовувати поточний каталог для робочих файлів і '-k 1,1' для
змусити сортування GNU використовувати перше поле Значення за замовчуванням: -T . -k 1,1
-системний сорт boolean
Значення за замовчуванням: Y
-прибирати boolean
Значення за замовчуванням: Y
Вихід розділ
- вихідний файл вихідний файл
-indexoutdir outdir
Значення за замовчуванням: .
Використовуйте dbifastae онлайн за допомогою служб onworks.net