Це команда gmt-music-bmrp, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
gmt music bmr - Розрахуйте охоплення генів і частоту фонових мутацій.
Версія
У цьому документі описано gmt music bmr версії 0.04 (2016-01-01 о 23:10:19)
СИНТАКСИС
gmt музика bmr ...
ОПИС
Ці інструменти є частиною пакету MuSiC.
ПІДКОМАНДІ
Загальні відомості
calc-bmr
Обчислює частоту мутацій з урахуванням охоплення кожного гена (з "music bmr calc-covg"), і
список мутацій
calc-covg
Використовує calcRoiCovg.c для підрахунку покритих основ на ген для кожної даної пари з нормою пухлини
БАМ.
calc-covg-helper
Використовує calcRoiCovg.c для підрахунку покритих основ на ген для пари BAM з нормою пухлини.
calc-wig-covg
Підрахуйте охоплені бази на ген для кожного файлу формату треку wiggle.
Використовуйте gmt-music-bmrp онлайн за допомогою служб onworks.net