Це команда gt-encseq-encode, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
gt-encseq-encode - Ефективне кодування файлів послідовності (FASTA/FASTQ, GenBank, EMBL).
СИНТАКСИС
gt encseq кодувати файл_послідовності [файл_послідовності [файл_послідовності ...]]
ОПИС
-показова статистика [так|ні]
показати результати стиснення (за замовчуванням: ні)
-ssp [так|ні]
позиції роздільників послідовності виведення у файл (за замовчуванням: так)
-від [так|ні]
вивести опис послідовності у файл (за замовчуванням: так)
-sds [так|ні]
Позиції роздільників опису послідовності виведення у файл (за замовчуванням: так)
-md5 [так|ні]
вивести суми MD5 у файл (за замовчуванням: так)
-clipdesc [так|ні]
описи кліпів після першого пробілу (за замовчуванням: ні)
-сів [рядок]
вкажіть тип представлення послідовності одним із ключових слів direct, bytecompress,
eqlen, bit, uchar, ushort, uint32 (за замовчуванням: не визначено)
-ДНК [так|ні]
вхідним є послідовність ДНК (за замовчуванням: ні)
-білок [так|ні]
вхідним є послідовність білка (за замовчуванням: ні)
- звичайний [так|ні]
обробляти як звичайний текст (за замовчуванням: ні)
-індексна назва [рядок]
вказати ім'я для індексу, який буде згенеровано (за замовчуванням: не визначено)
- smap [рядок]
вказати файл, що містить відображення символів (за замовчуванням: не визначено)
- без втрат [так|ні]
дозволити отримання оригінальної послідовності без втрат (за замовчуванням: ні)
-v [так|ні]
бути багатослівним (за замовчуванням: ні)
-допомога
відобразити довідку щодо основних параметрів та вийти
-допомога+
відобразити довідку для всіх параметрів і вийти
-версія
відобразити інформацію про версію та вийти
ЗВІТНІСТЬ БУГИ
Повідомте про помилки до[захищено електронною поштою]>.
Використовуйте gt-encseq-encode онлайн за допомогою служб onworks.net
