Це команда gt-eval, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
gt-eval – Порівняйте файли анотацій і відобразіть показники точності (прогноз та посилання).
СИНТАКСИС
gt евал файл_посилання_файл_прогнозування
ОПИС
-нук [так|ні]
оцінити рівень нуклеотидів (споживання пам'яті пропорційне розмірам вхідного файлу)
(за замовчуванням: так)
-лтр [так|ні]
оцінити прогноз LTR ретротранспозона замість прогнозу гена (всі
Вважається, що елементи LTR_retrotransposon мають невизначений ланцюг) (за замовчуванням:
немає)
-ltrdelta [значення]
встановити дозволену дельту для меж LTR, щоб вважатися рівними (за замовчуванням: 20)
-v [так|ні]
бути багатослівним (за замовчуванням: ні)
-o [ім'я файлу]
переспрямувати вихід у вказаний файл (за замовчуванням: не визначено)
-gzip [так|ні]
записати стиснений вихідний файл gzip (за замовчуванням: ні)
-bzip2 [так|ні]
записати стиснений вихідний файл bzip2 (за замовчуванням: ні)
- сила [так|ні]
примусово записувати у вихідний файл (за замовчуванням: ні)
-допомога
відобразити довідку та вийти
-версія
відобразити інформацію про версію та вийти
Програма показує значення чутливості та специфічності для певних типів функцій (наприклад,
ген, мРНК та екзон). Для деяких типів ознак кількість відсутніх і неправильних ознак
цей тип також показаний. Таким чином, «відсутня» означає кількість функцій цього типу
«посилання» без накладання на ознаку цього типу з «передбачення». Віце
навпаки, «неправильний» означає кількість ознак цього типу з «прогнозування» без
накладаються на об’єкт такого типу з «посилання».
ЗВІТНІСТЬ БУГИ
Повідомте про помилки до[захищено електронною поштою]>.
Використовуйте gt-eval онлайн за допомогою служб onworks.net
