Це команда gt-gff3validator, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн- емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
gt-gff3validator - сувора перевірка даних файлів GFF3.
СИНТАКСИС
gt gff3validator [опція ...] [GFF3_file ...]
ОПИС
-перевірка типу [рядок]
Використовуйте онтологію, наведену у файлі OBO, щоб підтвердити відносини між батьками та дітьми. Якщо ні
задано аргумент, використовується файл sofa.obo з каталогу gtdata/obo_files. Якщо
задається аргумент, він використовується як ім'я файлу OBO. У випадку, якщо такий файл робить
не існує .obo додається до аргументу і завантажує отримане ім’я файлу з
Спроба каталогу gtdata/obo_files. (за замовчуванням: не визначено)
-xrfcheck [рядок]
перевірте атрибути Dbxref та Ontology_term на правильний синтаксис відповідно до a
файл визначення абревіатури. Якщо аргумент не вказано, файл GO.xrf_abbs із файлу
Використовується каталог gtdata/xrf_abbr. Якщо вказано аргумент, він використовується як конкретний
ім'я файлу для файлу абревіатури. У випадку, якщо такого файлу не існує,
.xrf_abbr додається до аргументу і завантажує отримане ім’я файлу з
Спроба каталогу gtdata/xrf_abbr. (за замовчуванням: не визначено)
-допомога
відобразити довідку та вийти
-версія
відобразити інформацію про версію та вийти
ЗВІТНІСТЬ БУГИ
Повідомте про помилки до[захищено електронною поштою]>.
Використовуйте gt-gff3validator онлайн за допомогою служб onworks.net
