Це команда hmm-assembler.pl, яку можна запустити в безкоштовному хостинг-провайдері OnWorks за допомогою однієї з наших безкоштовних онлайн-робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
hmm-assembler.pl - модуль SNAP hmm-assembler.pl
СИНТАКСИС
hmm-assembler.pl [-ВАРИАНТИ [-БІЛЬШЕ ОПЦІЙ]] [--] [PROGRAM_ARG1 ...]
ВАРІАНТИ
Команда після односимвольне опції він має прийнято:
З аргументами: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
Логічний (без аргументів): -r -o -x -p -t -1
Опції можна об’єднати разом. -- припиняє обробку опцій. Простір не потрібен
між варіантами та їх аргументами.
варіанти:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 [] включає модель 3'UTR, вимагає -a
-a [] включає модель PolyA, вимагає -3
-5 [] включає 5'UTR moel, вимагає -p
-p включає загальну модель промоутера, вимагає -5
-r включають загальну модель повторення
-o включають зворотну модель ORF
-x використовувати явну інтронну модель тривалості
-t включає транс-сплайсинг C.elegans, вимагає -p, -5
-Z встановлює специфічні для клади значення (черв'як, муха, рослина)
-1 одногенна модель
-c
включають донорську модель зрощування GC-AG
Використовуйте hmm-assembler.pl онлайн за допомогою сервісів onworks.net